插入序列(Insertion sequences, ISs)是一种广泛分布的可移动元件，IS200/IS605和IS607家族的ISs是最简单的可移动遗传元件，只包含其转座及其调控所需的基因。这些元件通常携带末端回文序列，编码对移动至关重要的tnpA转座酶，并通常编码必不可少的辅助tnpB基因。ISDra2 TnpA是一个非常小的Y1转座酶，切割滞后链5’TTGAT序列形成单链滚轮，然后插入到TTGAT的3’完成转座，从而不产生靶点复制（target site duplication）。虽然TnpA在IS200/IS605转座子移动中的作用已被充分证实，但TnpB的功能仍然知之甚少。有人认为，TnpB在转座调控中发挥作用，但其机制尚未确定。有趣的是，生物信息学分析表明，TnpB可能是CRISPR Cas9/Cas12核酸酶的前身。然而，TnpB的核酸酶活性和RuvC-motif在转座中的角色还没有被证明。
近期，来自立陶宛维尔纽斯大学的Tautvydas Karvelis和Virginijus Siksnys等人发现来自耐辐射球菌ISDra2的TnpB是一个RNA导向的核酸酶，相关文章发表在Nature：Transposon-associated TnpB is a programmable RNA-guided DNA endonuclease。作者首先发现在大肠杆菌中表达tnpB需要与tnpA一起，说明可能需要额外的转座子元素稳定它的表达，并且发现RNA有RNA与TnpB共纯化。因此，他们对共纯化的RNA进行测序，发现富集的RNA与RE序列匹配（命名为reRNA）。接下来，他们假设TnpB可以被reRNA引导并切割DNA，体外用TnpB RNP和reRNA复合物、体内用表达tnpB和reRNA复合物的质粒实验证明它在reRNA的引导下剪切靠近5’TTGAT转座子相关基序(transposon associated motif, TAM)的DNA。最后，他们证明TnpB可以被重新编程切割人类细胞中的DNA靶位点。
ISDra2 TnpB:
MIRNKAFVVRLYPNAAQTELINRTLGSARFVYNHFLARRIAAYKESGKGLTYGQTSSELTLLKQAEETSWLSEVDKFALQNSLKNLETAYKNFFRTVKQSGKKVGFPRFRKKRTGESYRTQFTNNNIQIGEGRLKLPKLGWVKTKGQQDIQGKILNVTVRRIHEGHYEASVLCEVEIPYLPAAPKFAAGVDVGIKDFAIVTDGVRFKHEQNPKYYRSTLKRLRKAQQTLSRRKKGSARYGKAKTKLARIHKRIVNKRQDFLHKLTTSLVREYEIIGTEHLKPDNMRKNRRLALSISDAGWGEFIRQLEYKAAWYGRLVSKVSPYFPSSQLCHDCGFKNPEVKNLAVRTWTCPNCGETHDRDENAALNIRREALVAAGISDTLNAHGGYVRPASAGNGLRSENHATLVV*
reRNA Bone:
GATTCAAGAATCCCGAAGTGAAGAATCTTGCCGTCCGTACATGGACTTGCCCGAACTGTGGGGAAACCCATGACCGAGACGAGAACGCTGCGCTGAACATTCGGCGTGAAGCGTTGGTGGCTGCGGGAATCTCAGACACCTTAAACGCTCATGGAGGCTATGTCAGACCTGCTTCGGCGGGCAATGGTCTGCGAAGTGAGAATCACGCGACTTTAGTCGTGTGAGGTTCAA
靶点构建：
reRNA Bone+16bp Spacer +HDV 。
靶点：TTGAT（TAM）+16bp Spacer,如EMX1靶点：TTGAT GTGATGGGAGCCCTTCTTCT。
后续展望：真核生物可通过内源性转座酶实现基因编辑，只需要导入特定RNA即可。同时ReRNA大部分序列是否存在核酶的功能，也就是后续ReRNA可以精小化。